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基于网络药理学的麦冬治疗糖尿病成份以及机制及其配伍后浸染通路改动钻研(一)

来源:头一无二网 编辑:综合 时间:2024-10-17 15:23:14

糖尿病在中医属于消渴畛域,基于机制及以阴液盈利为本、网络燥热偏胜为标。药理研麦冬养阴润燥、麦冬清热生津,治疗能疗消渴阴虚之本。糖尿文献报道,病成麦冬发挥降糖浸染的份及成份多为麦冬多糖。麦冬中还含有70余种甾体皂苷、配伍30余种高异黄酮类化合物,后浸其是染通否有潜在降糖活性尚未清晰。

中药中重大的动钻化学成份经由多靶点、多蹊径发挥浸染,基于机制及经由配伍以及组方与其余药味相互浸染,网络配合发挥药效。药理研网络药理学部份性、系统性以及重视药物间相互浸染的特色与中医药学的根基特色适宜合,有利于揭示中药重大的浸染机制。

中医治疗糖尿病主要以清热润燥、养阴生津为主。因为本病常发生血脉瘀滞及阴损及阳的病变,且易并发痈疽、眼疾、劳嗽等症,故还应针对于详尽病情,实时公平川选用活血化瘀、清热解毒、健脾益气、滋补肾阴、温补肾阳等治法。麦冬养阴润燥、清热生津,疗消渴阴虚之本,黄芪补气升阳、布津摄液;北沙参多入上焦,清肺热、养肺阴,麦冬善入中焦,清胃热、益胃阴,两药相须为用;丹参活血化瘀,黄连清热泻火,配伍麦冬增强清热之力,使火去而津液自复,补虚而泻实;麦冬-山药-五味子三药适用,可增强补肾养阴、润肺浸染。本钻研依据中医补气、滋阴、清热、活血、酸甘化阴等治疗糖尿病根基的组方配伍方式,钻研麦冬单味药及配伍后治疗糖尿病的潜在活性成份及浸染机制,为进一步散漫麦冬配伍后成份变换纪律、血清药归天学、代谢组学、体外及体内降糖活性追踪等技术探究其详尽成份群提供参考。

1 资料与方式

1.1 麦冬及其配伍后化学成份与靶点的获取

釆用TCMID(http://www.megabionet.org/tcmid/)、Batman-TCM(http://bionet.ncpsb.org/ batman-tcm/)数据库,散漫文献发掘的方式,收集麦冬单味药及其配伍的化学成份。

依据Batman-TCM数据库默认的阈值(prediction score cutoff>20),筛选可信度高的卵白作为候选靶点,其中麦冬为重点钻研工具,阈值抉择prediction score cutoff>15。运用UniProt数据库中UniProtKB功能(http://www.uniprot.org/),限度卵白物种为人,校对于卵白称说。

1.2 糖尿病浸染靶点的获取

在CTD(http://ctdbase.org/)、TTD (http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/)、DrugBank (https://www.Drugbank.ca/)数据库输入diabetes、diabetes mellitus等紧张词,取患上糖尿病相干靶点。

1.3 药味-成份-靶点网络的构建

将筛选患上到的成份以及靶点数据导入Cytoscape 3.7.2软件(http://www.cytoscape.org/),构建药味-成份-靶点网络。

1.4 卵白质-卵白质相互浸染(PPI)网络构建及合成

运用STRING 10.0(http://string-db.oig/)工具构建麦冬及其配伍后靶点PPI网络,并妨碍拓扑合成以及模块合成。拓扑合成接管Cytoscape 3.7.2软件妨碍Network Analyzer合成。以网络节点中的拓扑结构特色值度(degree)以及中介中间度(betweenness centrality, BC)为指标筛选紧张靶点。模块合成接管Cytoscape 3.7.2软件ClusterViz插件中的MCODE算法,配置score>2,即至少包罗3条边。

1.5 通路合成

经由DAVID 6.8(https:// david.ncifcrf.gov/)数据库对于上述预料患上到的紧张靶点信息妨碍基因本体(GO)富会集成以及都门基因与基因组百科全书(KEGG)通路诠释合成,并运用GraphPad Prism 5绘图。

2 服从

2.1 麦冬及其配伍后成份以及靶点筛选

共筛选患上到麦冬化学成份22个、靶点236个;黄芪化学成份以及靶点分说为3五、415个,麦冬与黄芪配伍共有靶点为96个;黄连化学成份以及靶点分说为2三、132个,麦冬与黄连配伍共有靶点为24个;山药化学成份以及靶点分说为20、478个,五味子化学成份以及靶点分说为1十二、930个,麦冬与山药、五味子配伍共有靶点为146个;丹参化学成份以及靶点分说为7五、769个,麦冬与丹参配伍共有靶点为82个;北沙参化学成份以及靶点分说为1七、181个,麦冬与北沙参配伍共有靶点为172个。

2.2 糖尿病靶点筛选

基于多个数据库共检索到糖尿病相干靶点181个,其中麦冬波及靶点20个,占糖尿病靶点数的11.05%;麦冬与黄芪共有相干靶点13个,黄芪波及靶点27个,分说占糖尿病靶点数的7.18%、14.91%;麦冬与黄连共有相干靶点9个,黄连波及靶点13个,分说占糖尿病靶点数的4.97%、7.18%;麦冬与山药共有相干靶点14个,山药波及靶点32个,分说占糖尿病靶点数的7.73%、17.68%;麦冬与五味子共有相干靶点13个,五味子波及靶点41个,分说占糖尿病靶点数的7.18%、22.65%;麦冬与丹参共有相干靶点9个,丹参波及靶点41个,分说占糖尿病靶点数的4.97%、22.65%;麦冬与北沙参共有相干靶点11个,北沙参波及靶点13个,分说占糖尿病靶点数的6.08%、7.18%;麦冬与各药味配伍后,波及靶点58个,占糖尿病靶点数的32.04%。药味-成份-靶点网络见图1。

2.3 PPI收招集成

运用STRING工具构建PPI网络,见图2。其中麦冬单味药治疗糖尿病靶点的PPI网络包罗20个节点以及24条边;麦冬与黄芪配伍治疗糖尿病靶点的PPI网络包罗33个节点以及74条边;麦冬与黄连配伍治疗糖尿病靶点的PPI网络包罗24个节点以及36条边;麦冬与丹参配伍治疗糖尿病靶点的PPI网络包罗51个节点以及259条边;麦冬与北沙参配伍治疗糖尿病靶点的PPI网络包罗22个节点以及33条边;麦冬与山药、五味子配伍治疗糖尿病靶点的PPI网络包罗48个节点以及244条边;麦冬与所有药味配合配伍后,共包罗58个节点以及330条边。

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相干链接:麦冬五味子糖尿病

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