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碱性卵白酶降解鲢鱼肌原纤维卵白的组学合成(三)

来源:头一无二网 编辑:热点 时间:2024-10-16 21:27:13

2.3.2差距卵白质的碱性解鲢份子功能分类

合成鲢鱼肌原纤维卵白质组的功能状态,将差距卵白质妨碍Level8级别上的卵白基因本体的诠释,被分为3个种别。酶降从表6患上悉,鱼肌原纤ATPase活性功能(ATPaseactivity)包罗1个卵白点,维卵为点3504;肌动行动功能(motoractivity)包罗3个卵白点,组学分说为:5503,合成5504,碱性解鲢6512;腺嘌呤核苷酸散漫功能(adenylribonucleotidebinding)包罗4个卵白点,卵白分说为点1012,酶降3504,鱼肌原纤6512,维卵1105。组学

2.3.3差距卵白质的合成生物历程分类

运用GO的功能对于判断出的差距卵白质点妨碍Level5级别上的生物历程分类以及判断,见表7所示。碱性解鲢差距卵白质可能被分为35个生物蹊径,其中,包罗一个卵白质的生物历程有:肌动卵白行动、肌肉系统历程、骨架结构、有机氮化合物分解历程、杂环化合物分解历程、细胞身特意形、细胞凋亡调节、含磷化合物代谢历程、有机环状化合物应激、细胞含氮化合物代谢历程、细胞器组装、有机磷酸酯代谢历程、卵白亚基组成复合体历程、嘌呤化合物代谢历程、脂类应激、肌肉机关发育历程、馥郁族化合物代谢历程、糖类衍生物代谢历程、糖基化合物分解历程、有机环状化合物分解历程、细胞分解历程、细胞历程的负调控、含碱基化合物代谢历程、金属离子应激历程、循环系统历程、激素应激历程、乙醇应激历程、细胞凋亡妄想历程,共30个生物历程,其包罗的卵白质点均为点3504。

信号传导历程包罗1个卵白点0116;规范历程包罗1个卵白点6512;微管发育历程包罗3个卵白点2402,1410及5302;胚胎发育历程包罗4个卵白点2402,1410,5302及6512;机关形态组成历程以及系统发育历程包罗5个卵白点2402,1410,5302,4203及3504;形态发育历程中的解刨学结构组成历程包罗6个卵白点2402,1410,5302,4203,6512及3504。服从表明,这些卵白点在降解历程中可能退出多种生物蹊径,且1个卵白可能退出多个生物蹊径。赵巧灵[10]在金枪鱼冷藏历程中判断差距卵白质中发现有5种对于肌原纤维结构卵白质,分说是肌球卵白重链-一、肌球卵白轻链-一、肌球卵白轻链-三、α-肌动卵白以及β-肌动卵白。

2.4差距卵白点的生物信息学合成

肌动卵白在体内平凡以球形肌动卵白(G-肌动卵白)以及纤维性肌动卵白(F-肌动卵白)两种方式存在,是组成细胞骨架以及肌小节的主要卵白质,主要退出肌肉缩短。肌动卵白结构中散漫位点较多,可与多种卵白质相散漫,以发挥差此外细胞功能。它与肌球卵白散漫,使肌球卵白ATP酶的活性变大,为肌肉的行动提供能量,其与肌球卵白相互浸染,匆匆使肌肉行动。

在本钻研中,被判断为肌动卵白及相干卵白的卵白点包罗4℃组中的点0510,1410,3504,3413,1105,1005,0014以及6406,25℃组中的点2402,2304,5302以及4104。其中,4℃组中点0510,1410,3504,3413泛起下调,点1105,1005以及0015泛起上调,而点6406的品貌泛起初回升后着落的趋势;25℃组中点2402以及2304泛起下调,而点5302以及4104的品貌泛起初回升后着落的趋势。表明在降解历程中,碱性卵白酶破损肌动卵白,使其被分解为多个基团,而泛起初回升后着落趋势的卵白点仍需要进一步钻研。

肌球卵白在鱼肌肉中含量约50%,而且它与肉的热凝胶能耐有着较为紧张的关连。肌球卵白是一种大的不同过错称份子,具备一条α-螺旋组成的螺旋状颈部以及2个份子品质为500ku,具备ATPase活性的球形头部区域,总体而言,其包罗2条重链(MHC)以及4条轻链(MLC)。肌球卵白具备两种轻链,一种是调节轻链,其在磷酸化浸染以及去磷酸化浸染中有侧紧张浸染,另一种是根基轻链,同时也被称为碱性轻链。肌球卵白重链是骨骼肌粗肌丝的紧张组成单元,其表白量高下影响肌纤维的组成以及肌肉愿望。肌球卵白重链包罗3个结构及功能差此外结构域:头部结构域的结构最激进,它具备与ATP、肌动卵白散漫的位点;结构域为α-螺旋的颈部,它经由与调节轻链亚基相散漫来调节头部的活性;尾部结构域含有决定尾部是否与膜散漫,仍是与此外的尾部相散漫的位点,由此它决定是否产生肌球卵白二聚体概况肌球卵白纤维。在本钻研中,与肌球卵白及相干卵白质无关的卵白点有4℃组中的0007以及6512,在降解历程中,点0007的品貌泛起下调趋势,而点6512的品貌则泛起回升趋势。

同时,肌球卵白重链可能被酶解为重酶解肌球卵白以及轻酶解肌球卵白。重酶解肌球卵白具备肌球卵白全副的ATPase活性,轻酶解肌球卵白则对于细丝的组成有侧紧张浸染。在本钻研中,质谱判断服从为轻酶解肌球卵白相干卵白质的卵白点包罗4℃组中的点5006以及25℃组中的点5503,其品貌均在酶解历程中泛起回升趋势,详尽机制仍有待钻研。

HypotheticalproteincypCar_00047572(点0116)在降解历程中泛起回升趋势,依据前面的GO功能诠释患上悉,此卵白点与信号传导无关;hypotheticalproteincypCar_00035009(点6407)在降解历程中泛起初回升后着落的趋势,依据GO功能诠释,此卵白是中间丝骨架及骨架结构全副的组成全副;hypotheticalproteincypCar_00036471,partial(点5504)在降解历程中泛起回升趋势,依据GO功能诠释患上悉,此卵白点同样是中间丝骨架及骨架结构全副的组成全副,同时其又与肌动行动功能无关;hypotheticalproteincypCar_00048243(点4203)在降解历程中泛起回升趋势,依据GO功能诠释,此卵白点退出机关形态组成历程、系统发育历程及形态发育历程中的剖解学结构组成历程。可是这4个卵白点相干钻研较少,仍需进一步钻研。

2.5差距卵白质代谢蹊径

当初,对于水产物卵白质微生物降解机制钻研较少,经由KEEG代谢蹊径合成无奈找到肌原纤维卵白的降解蹊径。经由前文降解历程中生物信息学合成,可判断,在降解历程中,碱性卵白酶将肌原纤维卵白结构睁开,破损其骨架,使肌动球卵白解体为肌动卵白及肌球卵白。随后,碱性卵白酶主要浸染于肌原纤维卵白组分中的肌动卵白及肌球卵白,分说将肌动卵白降解为肌动卵白的多个肽段,将肌球卵白降解为肌球卵白重链以及轻酶解肌球卵白。

3论断

在4℃以及25℃条件下,随着碱性卵白酶解决光阴的削减,卵白图谱中卵白点的数目泛起初削减后削减的趋势。判断碱性卵白酶降解肌原纤维卵白的蹊径可能是首先破损肌原纤维骨架结构,肌动球卵白解体为肌动卵白以及肌球卵白,随后,肌球卵白及肌动卵白进一步被分解为此外产物如肌球卵白重链等。

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相干链接:卵白酶原纤维卵白腺嘌呤核苷酸

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